Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中病原体表观遗传标记的存在

2021-10-12 18:36:28 来源:
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导言:在最初阶段,自然界就开始了在不改变寄生虫线粒体DNA组织排序的必需下来使其DNA发挥完全相同的功用,而这就是通过给DNA残基上添加质理标记来实现的。DNA丝氨酸是动质的关键一般时说来性状机制,其里面5-甲基胞嘧啶(5mc)是最常见的DNA修饰之一。6mdA是寄生虫比方时说修饰系统对的基本组成成份,目前在动质里面缺乏已知的比方时说修饰系统对。在此之后有不少科学研究报道,6mdA也普遍存在于动质里面,但并无证据全力支持。

亦同,在《科学进展》上的一项科学研究里面,瑞典林雪平所大学的科学研究医护人员暗示,动质线粒体里面普遍存在寄生虫一般时说来性状标记很可能被污染物了,并且不会够大的证据来显然动质里面普遍存在这种修饰。

N6-甲基腺嘌呤(6mdA)是寄生虫里面广泛的DNA修饰,但最近在动质DNA里面也给予了表征。然而,科学研究医护人员所写,即使对来自相近动质线粒体类型的DNA进行的6mdA谱图和稀土元素测量科学研究也不一致。

为了有利于阐明6mdA在动质谱系的设计里面的作用,科学研究医护人员利用了体外将本能幼稚T特别设计(NTH)线粒体分化为TH线粒体亚群的战斗能力。但是,与在此之后的科学研究比如说,他们发现TH分化过程里面6mdA的稀土元素不会全局变化,并且捕捉到到分化的T线粒体里面的6mdA低水平与不曾丝氨酸的全基因组增为DNA相近,这暗示6mdA并不曾以可检查的低水平普遍存在本能T线粒体里面。

他们还分析了从六个本能线粒体系里面分离不止的DNA里面的6mdA,并确认不止两个兼具略低于背景噪声低水平的6mdA低水平的线粒体系。不止乎意料的是,两种分开的293T线粒体系培养质兼具完全相同的6mdA低水平,这暗示科学研究医护人员捕捉到到的6mdA波形并非线粒体类型本身固有的。确实,当他们有利于看时,他们发现两条6mdA低水平下降的线粒体系被阴性菌属污染物,阴性菌属一种常见的寄生虫线粒体培养质里面矿质质6mdA的污染物质。当他们用阴性菌免疫抗生素Plasmocin处理线粒体系时,6mdA波形增加为WGA阴性依此。

“我们意识到通过这些关键技术检查到的6mdA'波形'只是噪声。但是,由于一些十分复杂的关键技术问题,几种作法里面的背景噪声不是随机的,而是相符波形。”见习作者Colm Nestor(科尔帕·内斯特)在一份声明里面时说。

科学研究医护人员分析了以前通过DNA免疫沉淀PCR、质谱和单质理键系统对对PCR在动质线粒体里面定位或检查6mdA的期望。人们发现每种作法都有局限性或缺陷,使一般时说来性状标记的假阳性发现率很高,似乎暗示林雪平科学研究医护人员认为不普遍存在这种现象的证据。

这组作者所写:“我们显然,RNA和寄生虫污染物、抗原交叉反应性和其他关键技术受限制的结合已导致6mdA在动质DNA里面的有规律正确识别。随着DNA和RNA修饰家族的不断增长,以及以前难以确定修饰的丰富性越来越相似,即使用到多种有序作法,我们也强调了正确发现的可能性。我们同意用到修饰和不曾修饰的基因组DNA标准作为今后对稀有DNA修饰的科学研究的最高要求,以及在用到前更全面地验证抗原免疫。”

内斯特必需时说,科学研究医护人员在科学研究更加相似的现象时必须更加小心,选择用到哪种作法,并考量他们是否真正在衡量标准普遍存在的事质。他时说:“现在我们可以毫无疑问地时说动质里面不普遍存在6mdA。关于6mdA,如果科学研究医护人员暂缓科学研究根本不普遍存在的东西,则可以花费大量时间和钱财,并且避免了很多令人沮丧的事情。”

重构不止处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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